образована решением Священного Синода от 2 октября 2013 г. путем выделения из состава Барнаульской епархии.
Правящему архиерею Синод постановил иметь титул Горноалтайский и Чемальский.
Епархия объединяет приходы в административных границах Республики Алтай. Кафедральный город - Горно-Алтайск, кафедральный собор - храм преподобного Макария Алтайского. Правящий архиерей - епископ Каллистрат (Романенко, с 2 октября 2013 г., с 4 декабря 2017 г. архиепископ). Епархия разделена на 2 благочиния - Горно-Алтайское и Онгудайское. В епархиальном управлении действуют отделы по социальному служению и благотворительности, по религиозному образованию и катехизации, по работе с молодежью, по взаимодействию с вооруженными силами и правоохранительными органами, по тюремному служению, по взаимодействию с казачеством, миссионерский, архитектурно-строительный, а также богослужебная комиссия и комиссия по канонизации святых. СМИ епархии представляет официальный сайт: http://eparhia-gorniyaltay.ru.
Монастыри
На территории епархии, в селе Чемал расположен Иоанно-Богословский скит барнаульского в честь иконы Божией Матери «Знамение» женского монастыря.