создана в 1934 г. вслед. преобразования Боровичского вик-ства Новгородской епархии; кафедральный город - Боровичи (Новгородская обл.). Единственным Боровичским епископом был Никита (Стягов), ранее викарный Боровичский архиерей, 9 янв. 1935 г. возведенный в сан архиепископа. 19 авг. 1936 г. архиеп. Никита скончался, а в 1937 г. власти возбудили дело против «контрреволюционной группировки церковников», созданной почившим архиереем. Перед судом предстали 60 чел., среди них приехавший в Боровичи после 15-летнего заключения архиеп. Полоцкий и Витебский Гавриил (Воеводин), прот. Иоанн Державин, др. священнослужители, монашествующие из Пятницкой пуст., активные прихожане. 17 дек. 1937 г. под Боровичами был расстрелян 51 чел., 9 чел. были приговорены к разным срокам заключения в лагерях. После 1936 г. епископы на Б. е. не назначались.
В 1924-1933 гг. существовала обновленческая Боровичская епархия, к-рой управляли: Александр Лебедев (21 марта 1924 - 23 окт. 1925, являлся также временно управляющим обновленческой Новгородской епархией), Николай Гиляровский (1 янв. 1925-1929), Александр Щербаков (1929-1930), Капитон Лавров (1930-1931), Аристарх Николаевский (29 июля 1931 - 9 авг. 1933), Геронтий Шевлягин (1933).
Вновь Б. е. образована решением Свящ. Синода от 28 дек. 2011 г. путём выделения из состава Новгородской епархии. Объединяет приходы в административных границах Боровичского, Мошенского, Окуловского, Хвойнинского, Пестовского и Любытинского районов Новгородской области. Включена в состав Новгородской митрополии. Правящему архиерею Свящ. Синод постановил иметь титул "Боровичский и Пестовский".
Епископом Боровичским и Пестовским избран архим. Ефрем (Барбинягра).