В нояб. 1859 г. имп. Александру II Николаевичу был направлен доклад Синода с ходатайством от жителей Таврической губ., поддержанным новороссийским и бессарабским генерал-губернатором гр. А. Г. Строгановым, об открытии на территории губернии самостоятельной епархии. 16 нояб. император утвердил доклад, была учреждена второклассная Таврическая и Симферопольская епархия, местом пребывания архиерея определен Симферополь, кафедральным стал Александро-Невский собор в Симферополе (1810-1829). Вскоре в Крыму были организованы духовно-учебные заведения. В 1861 г. открылось Симферопольское ДУ, в 1866 г.- Таврическое епархиальное жен. училище. 30 мая 1869 г. император подписал указ об учреждении Таврической ДС, в 1903 г. при семинарии был построен Трехсвятительский храм. Благодаря усилиям еп. Гурия (Карпова; 1867-1882; с 21 апр. 1881 архиепископ) в 1868/69 г. началось издание «Таврических епархиальных ведомостей», были построены здания ДС, консистории, мужского и женского духовных уч-щ, обустроен Таврический архиерейский дом, собраны средства на реконструкцию Александро-Невского собора, архиерей жертвовал средства на восстановление и развитие мон-рей.
Учреждение епархии способствовало упрочению монашеской жизни на Крымском п-ове. В 1860 г. был предоставлен самостоятельный статус бывш. киновиям бахчисарайского Успенского скита (см. Бахчисарайский в честь Успения Пресвятой Богородицы мужской монастырь): керченскому Катерлезскому (Катерлесскому) во имя великомученика Георгия Победоносца монастырю и Космы и Дамиана, святых бессребреников, мужскому монастырю под Алуштой. В 1864 г. учрежден Топловский во имя преподобномученицы Параскевы женский монастырь. Существовали небольшие скиты при архиерейских и монастырских подворьях: Введенский скит (учрежден в 1872) при Симферопольском подворье Бахчисарайского мон-ря, скит на архиерейском подворье при Воскресенском храме в Ялте, основанном в 1900 г., Космодамиановский скит (учрежден в 1907) при Геническом подворье Кизилташского во имя святителя Стефана Сурожского мужского монастыря, Благовещенский скит при Симферопольском подворье алуштинского Космодамиановского мон-ря (основан в 1907), скиты при Керченском подворье Катерлезского мон-ря, при Феодосийском подворье Топловского мон-ря. После 1917 г. эти подворья стали самостоятельными обителями, в 20-х гг. XX в. были упразднены.
В 1905 г. в Севастополе открылось 3-е духовно-учебное заведение - Таврическая епархиальная школа псаломщиков. В том же году в Севастополе было завершено строительство и состоялось освящение Покровского собора, ставшего 2-м кафедральным храмом епархии. В 1909 г. праздновалось 50-летие Таврической и Симферопольской епархии.
Последним архиереем, возглавлявшим Таврическую и Симферопольскую епархию в синодальный период, был архиеп. Димитрий (см. Антоний (Абашидзе), 1912-1921; возведен в сан архиепископа 6 мая 1915). После начала первой мировой войны еп. Димитрий получил от властей разрешение принимать участие в походах Черноморской эскадры в качестве военного священнослужителя, 26 авг. 1915 г. архиерей был зачислен в состав штаба командующего Черноморским флотом. 24 марта 1916 г. император утвердил освобождение архиеп. Димитрия от обязанностей судового священника Черноморского флота и возвращение его к управлению Таврической епархией. Во время войны действовал епархиальный комитет для сбора пожертвований в пользу флота, половина епархиальных зданий была отдана под военные нужды. В февр. 1915 г. в Таврическом епархиальном жен. уч-ще начали работу курсы сестер милосердия, на к-рые сразу же записались 35 воспитанниц.
В послании к пастве от 5 марта 1917 г. архиеп. Димитрий поддержал отречение императора и уход в отставку царского правительства, назвав его «недобросовестно совершившим свое служение, злоупотребившим властью». Архиерей приветствовал «народовластие»: «Верховная власть вернулась к русскому народу, великому и пространством земли, и своей численностью, и духом,- устраивать на новых началах свою государственную жизнь». Симферопольское духовенство 19 апр. привело граждан и воинские части города к присяге на верность Российскому гос-ву и Временному правительству. В резолюции съезда духовенства и мирян Таврической епархии в мае 1917 г. декларировались взаимоотношения Церкви и гос-ва на началах «полной свободы Христовой Церкви», выражалась поддержка идее отделения Церкви от гос-ва. По требованию властей в июле 1917 г. был уволен ректор Таврической ДС еп. Иринарх (Синеоков-Андреевский), его в этой должности сменил поддерживавший революционные идеи архим. Вениамин (Федченков), хиротонисанный в февр. 1919 г. во епископа Севастопольского. В ночь на 5 окт. 1917 г. был ограблен и осквернен кафедральный Александро-Невский собор в Симферополе, сторож Ф. Рыжов убит.
В марте-апр. 1918 г. на территории Крыма существовала Советская Социалистическая Республика (ССР) Тавриды, включившая 5 уездов бывшей Таврической губ. За пределами республики оказалось 278 из 369 дореволюционных приходов епархии, объединенных в 15 благочиний: Мелитопольское, Большезнаменское, Григорьевско-Геническое, Малознаменское, Михайловское и Серогозское в Мелитопольском у., Бердянское, Ногайское, Ореховское, Большетокмакское и Черниговское в Бердянском у., Алёшковское, Каховское, Чаплынское и Новотроицкое в Днепровском у., а также Корсунский в честь Корсунской иконы Божией Матери муж. мон-рь и алёшковский Успенский жен. мон-рь. 1 апр. 1918 г. Симферопольский Совет рабочих, солдатских и крестьянских депутатов принял решение о конфискации здания Таврической консистории, к-рая прекратила работу. Во всех храмах стали читать молитву об устроении церковной жизни. В янв.-апр. 1918 г. погибли 19 священников Таврической епархии. 14 янв. 1918 г. матросы расстреляли настоятеля Покровского храма в с. Саблы прот. Иоанна Углянского. Почти 2 недели тело лежало на краю села, убийцы под угрозами расправы не давали совершить погребение. 28 янв. тело священника было перевезено в Симферополь, отпевание совершил архиеп. Димитрий. Попытка расправиться с настоятелем севастопольского Николаевского собора прот. священноисп. Романом Медведем оказалась неудачной. Клирик уехал в Москву, где патриарх Московский и всея России св. Тихон (Беллавин) назначил его 3-м священником в московский Покровский собор (Василия Блаженного).
В апр. 1918 г. Крым был оккупирован герм. войсками, в нояб. того же года перешел под контроль Антанты и Добровольческой армии, в апр.-июне 1919 г. существовала Крымская ССР в составе РСФСР. 24 июня 1919 г. Симферополь заняли части Вооруженных сил Юга России под командованием А. И. Деникина.
29 янв. 1919 г. вместо Таврической консистории был учрежден Таврический епархиальный совет духовенства и мирян. В июне 1918 г. архиеп. Димитрий предложил установить памятник-часовню в Ялте на месте погребения людей, погибших с 9 янв. по 30 апр. 1918 г. Архиерей принимал активное участие в работе Временного Высшего церковного управления на Юго-Востоке России (ВВЦУ ЮВР), являлся товарищем председателя, затем председателем ВВЦУ ЮВР. Летом 1920 г. ВВЦУ ЮВР предложило руководству войск Юга России провести дни покаяния «в связи с необходимостью оздоровления тыла в религиозно-нравственном отношении»; 25-27 сент. 1920 г. в храмах читалось послание ВВЦУ ЮВР, к-рое было подписано архиеп. Димитрием (Абашидзе), архиеп. Феофаном (Быстровым) и еп. Вениамином (Федченковым). Находившиеся в Крыму профессора КДА П. П. Кудрявцев и И. П. Четвериков в авг. 1920 г. подали докладную записку ВВЦУ ЮВР о создании в Симферополе высшей духовной школы. Проект был отклонен, преподавателям духовных учебных заведений Симферополя предложили организовать бесплатные курсы для всех интересующихся богословскими вопросами, архим. Серафим (Соболев) должен был обеспечить участие в работе курсов находившихся в Крыму профессоров духовных учебных заведений. Эти планы не были реализованы.
В нояб. 1920 г. более 145 тыс. чел., включая мн. священнослужителей, были эвакуированы из Крыма вместе с остатками Белой армии под командованием П. Н. Врангеля. Архиеп. Димитрий остался, по благословению патриарха Тихона в авг. 1921 г. он ушел за штат и поселился в Топловском мон-ре недалеко от Феодосии, где власти разрешили ему оставаться не более года. По указу патриарха Тихона 23 авг. 1921 г. управление Таврической епархией принял сщмч. Никодим (Кротков), возведенный в сан архиепископа. В 1920-1921 гг. имела место новая волна репрессий в отношении священнослужителей, их обвиняли в сочувствии белым, пропаганде монархизма, шпионаже и др. Массовые казни совершались не за преступления, но за предыдущую «контрреволюционную» жизнь или деятельность. В числе первых в 1920 г. были расстреляны священники Иустин Пигулевский (20 нояб.), Иоанн Плетнёв (21 нояб.). 3 дек. того же года в Феодосии были казнены священники Андрей Антименко, Димитрий Богословский, Андрей Животков, Иоанн Карманов, Андрей Красницкий, Павел Левицкий, Григорий Солодовников, Евлампий Щёкин, полковники Н. П. Кожущенко, Н. Н. Перекрестов, Е. П. Болховский, Г. Иноземцев и еще более 200 чел. 11 дек. в Керчи был расстрелян свящ. Василий Лоренцов, 16 дек. казнен протоиерей феодосийской Екатерининской ц. сщмч. Андрей Косовский. 25 дек. 1920 г. военно-революционный трибунал 4-й армии приговорил к расстрелу священника из с. Петровского Феодосийского у. Георгия Русановича за «сочувствие белым». 28 дек. расстреляли настоятеля собора в Керчи прот. Владимира Станиславского. В янв. 1921 г. расстреляны прот. Порфирий Мальцев, священники Ипполит Концевич и Владимир Сластовников. В янв.- февр. 1921 г. арестованы и высланы прот. Емельян Яскевич из Керчи, свящ. Виктор Баженов из Ялты, прот. Иаков Фролов, прот. Николай Никольский из г. Ст. Крым. 9 апр. 1921 г. в Евпатории расстрелян свящ. Петр Кудринский. В нач. 1921 г. трагически оборвалась жизнь бывш. Нижегородского архиеп. Иоакима (Левицкого): его нашли повешенным на даче неподалеку от Севастополя,- вероятно, архиерей был убит. В 1921 г. за связи с армией Врангеля были высланы с полуострова свящ. Дионисий Мартыненко из Ялты (в апр.), настоятель собора в Керчи прот. Александр Волков (в мае). 13 окт. 1922 г. арестовали служившего в ялтинском Александро-Невском соборе прот. Сергия Булгакова, 23 нояб. того же года он был выслан из РСФСР без права возвращения.
В 1921 г., после образования Крымской АССР, приазовские уезды бывшей Таврической губ. вошли в состав Екатеринославской губ. Украинской ССР, в церковном отношении стали частью Екатеринославской епархии (см. Днепропетровская и Павлоградская епархия). В Симферополе с 20 апр. 1921 г. существовала межведомственная комиссия по реализации декрета «Об отделении церкви от государства и школы от церкви». Действовавший в марте-окт. 1921 г. по инициативе архиеп. Никодима Союз приходских советов Симферополя делегировал своего представителя на собрания этой комиссии, однако при принятии решений его голос в расчет не брался.
В результате массовых репрессий против духовенства и «белогвардейских элементов» были созданы условия для насаждения на полуострове обновленчества. Не позднее мая 1922 г. в Симферополе была образована инициативная группа «Живой церкви», учредителем которой стал настоятель Скорбященской ц. прот. Евгений Эндека. В июне 1922 г. он отправился в Москву для консультаций с обновленческим Высшим церковным управлением (ВЦУ).
В нач. авг. 1922 г. по обвинению в сопротивлении изъятию церковных ценностей был арестован Таврическо-Симферопольский архиеп. Никодим (Кротков). 5 нояб.- 1 дек. 1922 г. в Симферополе проходил открытый суд в отношении 73 правосл. священнослужителей во главе с архиеп. Никодимом по обвинению в сопротивлении изъятию ценностей. (Ранее, 28 окт., на заседании президиума Крымского областного комитета партии был рассмотрен вопрос «О процессе церковников»; президиум поручил агитпропу развернуть в прессе агитационную «работу в момент начала и завершения процесса над священниками».) Самый суровый приговор был вынесен в отношении архиеп. Никодима - его приговорили к 8 годам лишения свободы со строгой изоляцией.
Сразу после суда обновленцы обратились к властям с просьбой передать им кафедральный Александро-Невский собор в Симферополе и незамедлительно получили положительный ответ, между тем как правосл. община еще летом 1922 г. собрала неск. сот подписей под такой же просьбой, оставшейся без рассмотрения. 18 дек. 1922 г. «староцерковники» попытались изгнать из собора обновленцев. На следующий день власти Крыма приняли решение о закрытии собора и создании в нем центрального хранилища церковного имущества. Собор был на длительное время опечатан, позднее закреплен за обновленцами.
После ареста архиеп. Никодима, в кон. авг. 1922 г., обновленческое ВЦУ назначило временно управляющим Таврической епархией еп. Николая. В сент. того же года в Симферополь из сев. уездов прибыли неск. священников-обновленцев, начавших агитационно-организационную работу. На базе местного комитета группы «Живая церковь» было создано обновленческое Таврическое епархиальное управление под рук. прот. Е. Эндеки. В окт. 1922 г. обновленцы Крыма пригласили на Симферопольскую кафедру «епископа» Петра Рождественского, ВЦУ утвердило его назначение. 9 окт. 1922 г. органы советской власти в Крыму передали раскольническому ЕУ епархиальную канцелярию, свечной завод, домашнюю церковь, неск. часовен, др. имущество.
В условиях агрессивного наступления обновленчества в ночь на 29 авг. 1922 г. архиепископы Никодим (Кротков) и Димитрий (Абашидзе) тайно хиротонисали во епископа Мелитопольского и Севастопольского исполняющего обязанности настоятеля симферопольского Петропавловского собора прот. Александра Зверева, принявшего монашество с именем Сергий (см. Сергий (Зверев), сщмч). Еп. Сергий был в числе обвиняемых на процессе, связанном с изъятием церковных ценностей, 1 дек. 1922 г. приговорен к году заключения, амнистирован, был вынужден покинуть Крым. В февр. 1923 г. на съезде духовенства и мирян Мелитопольского, Бердянского и Днепровского уездов еп. Сергий был избран главой Мелитопольского викариатства Таврической епархии, поселился в Мелитополе. После ареста и высылки из Крыма в мае 1923 г. архиеп. Димитрия (Абашидзе) еп. Сергий из Мелитополя управлял в т. ч. Таврической епархией: рукополагал священников для крымских приходов, противодействовал распространению обновленчества, оказывал помощь репрессированным священнослужителям. 11 мая 1923 г. еп. Сергий был арестован, из-за протестов верующих предполагавшаяся высылка архиерея в Архангельскую губ. была отменена, он вернулся в Мелитополь, осенью 1924 г. назначен управляющим Самарской епархией.
В 1923-1924 гг. в Крыму шло закрытие мон-рей. 5 окт. 1923 г. Президиум Крымского ЦИК принял решение о ликвидации Кизилташского, Космодамиановского и Топловского мон-рей, 6 дек. принято постановление о ликвидации бахчисарайского Успенского скита. 27 авг. 1924 г. закрыт херсонесский Владимирский муж. мон-рь, 15 дек. прошло вскрытие хранившихся в мон-ре ковчегов с частицами мощей многих святых.
В февр. 1923 г. по решению обновленческого Всеукраинского ВЦУ вместо «епископа» Петра в Крым был направлен Александр (Раевский). Приняв в обновленчестве монашеский постриг, он 27 янв. 1923 г. был хиротонисан во епископа Севастопольского, викария обновленческой Таврической епархии (см. в ст. Севастопольское викариатство). В 1924 г. еп. Александр принес покаяние, был принят в каноническую Церковь в сущем сане и назначен викарным епископом Керченским (см. Керченское викариатство), временно управляющим Таврической епархией. 31 марта 1925 г. на съезде крымских обновленцев Таврическое ЕУ было преобразовано в Крымское митрополитанское церковное управление; 15 и 28 апр. 1925 г. обновленческий синод издал соответствующие указы.
В дек. 1925 г. в симферопольском Александро-Невском соборе прошел съезд духовенства и мирян обновленческой Таврической епархии. Во главе Крымского митрополитанского управления был утвержден «митрополит» Алексий Замараев. Съезд принял решение о разделе митрополии на 3 епархии: Симферопольскую, Севастопольскую и Керченско-Феодосийскую. Алексий Замараев управлял обновленцами Крыма до своей смерти 17 апр. 1927 г., затем главой митрополитанского управления был назначен «митрополит» Анатолий Соколов. Его сменил прибывший в Симферополь 11 июля 1928 г. «митрополит» Иосиф Кречетович. Практически сразу у «митрополита» Иосифа начался конфликт с «архиепископом Севастопольским» Николаем Розановым. В связи с закрытием властями 10 дек. 1929 г. симферопольского Александро-Невского собора (уничтожен в ночь на 27 сент. 1930) «митрополичья» кафедра переместилась в симферопольский Петропавловский собор. 28 июля 1929 г. состоялось общее собрание духовенства и мирян Симферополя, где против Кречетовича были выдвинуты обвинения в растрате тысячи рублей и политической неблагонадежности. Тогда же от «двадцатки» в синод поступила жалоба на «митрополита» Кречетовича: его обвиняли в узурпации власти и политической неблагонадежности. 17 сент. 1929 г. Кречетович был арестован, приговорен к 3 годам заключения. Отбыв срок, Кречетович вернулся в Симферополь, где скончался 12 июня 1933 г. Главой Крымской обновленческой митрополии в 1929-1933 гг. был Иерофей Померанцев. В нояб. 1933 г. обновленческую кафедру Крыма возглавил «митрополит» Алексий Баженов. К 1936 г. число церквей на полуострове сократилось до 37, большинство из них были обновленческими.
Репрессии усилились в 1929-1930 гг. В июле 1930 г. из Севастополя были высланы 44 священнослужителя (из них 40 монашествующих), лишенные избирательных прав, в числе к-рых были архим. Дионисий (Чудновец), заштатный прот. Митрофан Василькиоти и др., с запретом жить ближе чем в 40 километрах от города. В др. больших городах также прошли групповые судебные процессы, после к-рых были высланы наиболее влиятельные клирики. В 1930 г. арестованы и высланы священники: Власий Васильченко из Симферополя, Александр Юрьев и Александр Тивернацкий из Керчи, Серафим Галицкий, Павел Янушевич и Андрей Тимешилов из Евпатории, Николай Царенко из Алупки, прот. Тарасий Матвеец из Феодосии, свящ. Феодор Мусин из с. Кишнав Феодосийского р-на, псаломщик-диакон Иоанн Максютенко из г. Ст. Крым, церковный староста И. Арабаджи из г. Бахчисарая и др.
25 июня 1930 г. «на Феодосийскую кафедру» с правом управления всеми правосл. приходами Крыма был назначен архиеп. Арсений (Смоленец). 11 сент. 1931 г. на Крымскую кафедру получил назначение еп. сщмч. Порфирий (Гулевич). Местом пребывания нового руководителя «староцерковного» движения в Крыму стал Симферополь, а не Феодосия. Архиеп. Арсений (Смоленец) 23 окт. 1931 г. был арестован крымскими органами НКВД и в течение неск. месяцев пребывал в заточении, затем на нек-рое время был уволен на покой. Статус кафедрального храма Крымской епархии перешел к Преображенской ц. на старом кладбище Симферополя. Еще одним действующим правосл. храмом в городе была Свято-Троицкая греч. ц. В 1933 г. городские власти сделали попытку закрыть храм, но греч. община Симферополя, в большинстве состоявшая из подданных Греции, добилась через греч. миссию в Москве сохранения храма. Еп. Порфирий регулярно служил в храмах епархии, призывал молиться «о сосланных и заключенных, невинно томящихся в изгнании архиереях, священстве, монашествующих и мирянах», мужественно проповедовал, открыто говорил о голоде на Украине. Активно выступал против обновленчества, что вызвало угрозы со стороны раскольников: обновленческий «митрополит» Иерофей Померанцев заявил с амвона, что еп. Порфирия ждет арест за преследование обновленцев. В 1933 г. еп. Порфирий был арестован, обвинен в том, что «в некоторых случаях свою контрреволюционную деятельность прикрывал церковной борьбой с обновленцами», говорил прихожанам, что «власть преследует тихоновцев и поощряет обновленцев». Два месяца он провел в тюрьме, затем был освобожден. Владыку вновь арестовали 9 окт. 1936 г. Еп. Порфирий был обвинен в том, что «он под видом проповедей в церкви произносит антисоветские речи, всячески поощряет нелегальную контрреволюционную деятельность монахов». После 4 месяцев тюремного заключения еп. Порфирий и прот. сщмч. Николай Казанский были приговорены к 5 годам ссылки. Владыка был отправлен в Казахстан, там вновь арестован, 2 дек. 1937 г. расстрелян.
В 1937-1938 гг. в Крыму шли массовые аресты духовенства - как служивших священников, так и тех клириков, к-рые уже годами трудились на светской работе. Наиболее массовым было групповое дело против духовенства и мирян Ялты, по к-рому в дек. 1937 г. были арестованы настоятель ялтинского Плещеевского храма прот. Арсений Савчинский и его помощник иеродиак. прмч. Антоний (Корж) (расстрелян 14 марта 1938). В 1938 г. в Крымской епархии пострадали священномученики Димитрий Киранов (расстрелян 4 янв.), Николай Мезенцев (приговорен к расстрелу 14 февр.), Тимофей Изотов (расстрелян 16 февр.), Иоанн Блюмович (расстрелян 13 апр.), преподобномученики Варфоломей (Ратных) (расстрелян 10 февр.), Владимир (Пищулин) (расстрелян 10 февр.). Сщмч. Елеазар Спиридонов скончался в лагере 6 дек. 1937 г., мч. Димитрий Спиридонов расстрелян 29 нояб. 1938 г., мч. Стефан Наливайко умер от голода в лагере 12 февр. 1945 г. Такая же участь была и у обновленцев. 15 февр. 1938 г. были осуждены тройкой НКВД по ст. 58.10 и 11 УК РСФСР и приговорены к расстрелу 15 чел. из числа «двадцатки» Петропавловского собора Симферополя во главе с обновленческим «митрополитом» Алексием Баженовым.
К началу Великой Отечественной войны единственным действующим храмом Крыма являлась Всехсвятская кладбищенская ц. в Симферополе, принадлежавшая обновленцам. В ней служили прот. Николай Швец (с 1904) и свящ. Стефан Шпаковский. В 1941 - нач. 1942 г. этими клириками руководил бывш. обновленческий «епископ» Викентий Никипорчук (Никипорчик), до этого долгое время работавший по гражданской специальности (в 1938-1939 находился в заключении). После оккупации немцами Крыма в нояб. 1941 г. все церковные дела были переданы в ведение специального отдела в созданном 22 нояб. 1941 г. Симферопольском городском управлении. Руководителем церковного отдела был назначен бывш. преподаватель Таврической ДС, противник обновленчества А. Д. Семёнов. При его содействии новым настоятелем Всехсвятской кладбищенской ц. стал прот. Евгений Ковальский. Это произошло в янв. 1942 г.
После того как Всехсвятский храм вернулся в каноническую Церковь и Викентию Никипорчуку власти отказали в признании его епископом, последний организовал в открывшемся в Симферополе храме равноапостольных Константина и Елены обновленческий приход. Викентий, как активный обновленец, стал объектом преследования со стороны Семёнова и со стороны авторитетного крымского священнослужителя, ранее репрессированного по доносам обновленцев, прот. Митрофана Василькиоти, ставшего в 1941 г. настоятелем Свято-Троицкой ц. в Симферополе. Никипорчук был избит в Симферополе группой прихожан, после чего его ближайший помощник - прот. Василий Пустовойт, священник Константино-Еленинского прихода, перешел из раскола в РПЦ. Викентий, ранее претендовавший на Крымскую кафедру, переехал в Мелитополь, где титуловался как «епископ Приазовский», установил контакты с принадлежавшим к Украинской автокефальной православной церкви (УАПЦ) «Елисаветградским епископом» Сергием Охотенко, жившим в г. Кривой Рог. В окт. 1942 г. Викентий был задержан в Мелитополе, направлен в концлагерь на территории бывш. совхоза «Красный». Позже освобожден, жил в Мелитополе, служил настоятелем Александро-Невского собора, являлся «епископом» для неск. приходов в Запорожской обл., был вторично арестован, казнен в 1943 г. Викентий крестил евр. детей, спасая их от смерти. Он крестил внука Эммануила, сына своей дочери Светланы и еврея Л. М. Лехно; несмотря на крещение, мальчик был замучен немцами.
На Крымском п-ове к апр. 1943 г. действовало 45 церквей. Не позднее сент. 1942 г. крымские приходы взял под свое окормление хиротонисанный 21 июля 1942 г. во епископа Николаевского, викария Херсонской епархии, Серафим (Кушнерук), принадлежавший к Автономной УПЦ. 15 дек. того же года он был назначен самостоятельным епископом Мелитопольским и Таврическим (см. в ст. Мелитопольская и Таврическая епархия), жил в Мелитополе, управлял приходами нем. генерального окр. Таврия, к-рый включал территорию Сев. Приазовья и Крымского п-ова; епархия также включала приходы в Бердянске, Ногайске (ныне Приморск), Каховке и Херсоне (эти города не принадлежали к окр. Таврия). К авг. 1943 г. в Крыму насчитывалось 70 действующих храмов, из них 6 - в Симферополе. К весне 1944 г. число открытых храмов достигло 82. В связи с попытками крымских греков отделиться и создать свою церковную юрисдикцию еп. Серафим 5 мая 1943 г. выступил с посланием, в котором выразил поддержку деятельности церковного отдела во главе с Семёновым по сохранению церковного единства. 14 мая 1943 г. еп. Серафим утвердил создание Крымского епархиального благочиннического совета, главой к-рого был избран старейший клирик региона благочинный прот. Митрофан Василькиоти. Фактическими руководителями совета были заместители прот. Митрофана прот. Павел Бобров и Семёнов. Все свои решения Крымский совет должен был согласовывать с Мелитопольско-Таврическим епархиальным управлением. При освобождении Мелитополя от фашистов в окт. 1943 г. подавляющее большинство духовенства Мелитопольско-Таврической епархии во главе с еп. Серафимом уехало в эмиграцию.
В февр. 1944 г. был создан благочиннический совет правосл. церквей Крыма. В состав нового совета вошли представители правосл. духовенства и миряне, председателем был избран настоятель симферопольской Всехсвятской ц. прот. Евгений Ковальский, заместителем - настоятель Трехсвятительской ц. в Симферополе прот. Иоанн Милославов, секретарем - Семёнов. До апр. 1944 г. совет успел издать неск. тысяч молитвенников и поминальных книг, принять решение об открытии в Симферополе 7-го правосл. храма - Петропавловского собора. Собор нуждался в капитальном ремонте, 2 апр. 1944 г. газ. «Голос Крыма» призвала население к финансовой поддержке восстановления храма.
В мае 1944 г. Крым был освобожден от оккупантов. 30 июня 1944 г. благочиннический совет церквей Крыма прекратил работу, вместо него было образовано Временное епархиальное управление церквами Крыма, временно управляющим делами Крымской епархии стал настоятель симферопольской Благовещенской ц. прот. Иоанн Крашановский, его заместителями - прот. Иоанн Милославов и свящ. Порфирий Клягин. 22 авг. 1944 г. в Крым приехал хиротонисанный 13 авг. того же года во епископа Симферопольского и Крымского Иоасаф (Журманов). Вскоре власти арестовали бывш. главу церковного отдела Симферопольского городского управления Семёнова, к-рый признал свою причастность к доносам на прот. Николая Швеца, казненного немцами. Также в 1944 г. были арестованы бывш. глава Крымского епархиального совета, настоятель симферопольской Всехсвятской ц. прот. Евгений Ковальский, настоятель Покровского собора в Севастополе прот. Стефан Жёлтиков, настоятель собора в Керчи прот. Николай Попов (к наст. времени не реабилитированы). Помимо них в ходе послевоенных репрессий в 1944-1951 гг. на полуострове арестованы и осуждены 23 правосл. священника и псаломщика (реабилитированы). В апр. 1944 г. в Симферополе были арестованы псаломщики Г. П. Грачёв, Н. И. Панков и псаломщица Е. С. Гулак. В нояб. 1944 г. в рамках групповых дел арестованы священники Хрисанф Брагинец из Евпатории и Иаков Проскурин из с. Чистополье Маяк-Салынского р-на. В янв. 1945 г. арестован за антисоветские высказывания настоятель Александро-Невского собора в Ялте прот. Алексий Моссиенко, от заключения в лагерь его не спасло сотрудничество в период оккупации Крыма с советским партизанским подпольем. Также в 1945 г. арестованы прот. Захария Слюсарев и псаломщик И. П. Сервули из Симферополя, прот. Николай Цитович из г. Саки, свящ. Николай Чёрный из дер. Григорьевка Октябрьского р-на и настоятель храма в пос. Курман свящ. Константин Павленко.
В отношениях с властями еп. Иоасаф был уступчивым. В Симферополе после ухода немцев было учтено 7 действующих церквей и молитвенных домов. Архиерей своим распоряжением 2 церкви объединил с др. храмами. В Ялте 3 храма объединены в один приход с оставлением одной действующей церкви. Еп. Иоасаф ввел должность епархиального ревизора и обратился к местному уполномоченному Совета по делам РПЦ с просьбой рекомендовать к.-л. мирянина на эту должность. Власти поставили своего кандидата,- т. о., хозяйственная деятельность храмов была взята под контроль. К авг. 1944 г. в Крыму имелось 3 обновленческих прихода. Два обновленческих священника обратились к еп. Иоасафу с просьбой принять их в общение с канонической Церковью, оба были приняты и оставлены настоятелями храмов. Третий священник заявил, что духовной власти над собой не признаёт, признаёт только советскую власть, он также был оставлен в должности настоятеля храма.
5 апр. 1946 г. на Крымскую кафедру получил назначение архиеп. священноисп. Лука (Войно-Ясенецкий). К кон. 1946 г. в Крымской епархии, разделенной на 8 благочиннических округов, насчитывалось 57 приходских церквей, имели регистрацию 77 священно- и церковнослужителей (57 священников, 5 диаконов, 15 штатных псаломщиков). Кафедральным являлся Свято-Троицкий собор в Симферополе. Большая часть крымского духовенства была малообразованной, мн. клирики имели канонические препятствия к совершению служения, церковная дисциплина была низкой. В 1947 г. архиерей уволил за штат 3 священников, 6 были лишены сана, один стал служащим гос. учреждения, 5 были отпущены в др. епархии. В том же году архиеп. Лука рукоположил 15 иереев по своему выбору. В отличие от своего предшественника архиеп. Лука оказывал помощь пострадавшим от репрессий священникам. В нач. 1946 г. еп. Иоасаф по требованию уполномоченного Совета по делам РПЦ отправил за штат архим. Тихона (Богославца) как нелояльного к властям, архиеп. Лука сразу же после приезда в Симферополь восстановил архим. Тихона в клире епархии и назначил епархиальным духовником вопреки возражениям уполномоченного.
Во 2-й пол. 40-х гг. XX в. аресты клириков в Крыму продолжались. В 1946 г. были осуждены прот. Алексий Салух из Феодосии, свящ. Никандр Балюк из Белогорска, священнослужители из Симферополя диакон-псаломщик Александр Каленич и прот. Леонтий Чепелевский. В 1949 г. арестовали протоиерея кафедрального собора в Симферополе Григория Афанасьева, рукоположенного архиеп. Лукой годом ранее. В 1949 г., несмотря на протесты архиерея, арестованы и высланы из Крыма священники Михаил Рогов и Сергий Дубровин как ранее судимые и не могущие проживать на «режимной приграничной территории». В 1947 г. архиерей обратился к властям с протестом против необоснованного ареста прот. Николая Ольшанского из с. Грушевка (до 1945 Салы) Старокрымского р-на (ныне городского окр. Судак). Период 1948-1953 гг. отмечен новым витком гонений на правосл. Церковь. Мн. храмы были закрыты и снесены, приходская жизнь нарушена. Продолжались аресты священников. Так, в 1950 г. по сфабрикованным обвинениям в антисоветской агитации арестован прот. Григорий Безродный из пос. Красногвардейское, в 1951 г. по обвинению в совершении тайных крещений арестован свящ. Стефан Ковшик из с. Магазинка Красноперекопского р-на. В 1952 г. в тюрьме умер находившийся под следствием прот. Василий Углянский из Симферополя.
Начиная с 1951 г. архиеп. Лука способствовал переводу в Крым клириков с Зап. Украины. За 10 последующих лет в Крым с Украины приехали 25 священников и 3 диакона, благодаря чему все вакансии в приходских церквах были замещены. Такой же большой наплыв западноукр. духовенства наблюдался и в соседних с Крымом епархиях: Днепропетровско-Запорожской и Ростовско-Новочеркасской, что было вызвано массовым закрытием храмов в западных областях Украины и появлением значительного числа безместного духовенства. Однако и эта мера не смогла предотвратить массовое закрытие храмов в условиях антирелиг. кампании 1958-1964 гг. (см. в ст. Хрущёв Н. С.).
К 1958 г. в Крыму насчитывалось 48 приходов, служили 47 священников, 7 диаконов. В период новой волны гонений, в 1958-1963 гг., были упразднены старинные и наиболее вместительные крымские храмы: Покровский и Благовещенский в Симферополе, Покровский собор в Севастополе, Илиинский храм в Евпатории, Феодоро-Стратилатовский в Алуште, Феодоро-Тироновский в Ялте и др. К нач. 1961 г. действующими оставались 29 церквей, на регистрации состояли 26 священников. В 1961-1963 гг. были сняты с регистрации еще 14 церквей, действующими остались 15 храмов. Подвергались травле близкие к архиеп. Луке наиболее деятельные священники. Трое из них - протоиереи Виталий Карвовский, Михаил Рыхлицкий и Алексий Марковский - в 1959 г. были сняты с регистрации, находились под угрозой ареста, их фактически принуждали уехать из Крыма. Отдельные клирики под давлением властей сняли духовный сан с письменными отречениями в местной прессе, что сопровождалось нападками на архиеп. Луку и его окружение.
После кончины архиеп. Луки в 1961 г. процесс закрытия храмов ускорился, несмотря на то что церковные интересы активно защищал и следующий управляющий епархией - митр. Гурий (Егоров), занимавший Крымскую кафедру в 1961-1965 гг. Власти пытались усилить конфликты внутри крымского духовенства - между клириками местного происхождения и выходцами с Зап. Украины. Последних уполномоченный пытался выдавливать из епархии, хотя и малоуспешно. Благодаря ходатайствам в Москву настоятеля Александро-Невского собора в Ялте прот. Андрея Кухарчука и прихожан местные власти вынуждены были отказаться от планов закрыть собор, потому что Александро-Невский собор и храм при усадьбе А. П. Чехова в Ялте являлись обязательными пунктами маршрутов иностранных церковных делегаций при посещении Крыма в 60-80-х гг. XX в.
К сер. 80-х гг. ХХ в. в С. и К. е. насчитывалось 13 храмов. Возвращение разоренных церквей и возобновление приходов в епархии начались в 1988 г. Управляющий епархией митр. (с 10 марта 1989) Леонтий (Гудимов) ходатайствовал перед властями о передаче храмов для церковных нужд, при нем удалось добиться передачи 13 храмов, было создано 10 новых приходов. Создание приходских общин продолжилось при еп. Василии (Златолинском; 1990-1992), были открыты катехизаторские курсы для мирян, в 1991 г. началось издание епархиальной газ. «Крым православный».
27 июля 1992 г. архиепископом Симферопольским и Крымским был назначен Лазарь (Швец; с 25 нояб. 2000 митрополит). При нем началось полномасштабное возрождение церковной жизни. В 1997 г. в здании бывшей Таврической ДС в Симферополе открылось духовное училище, при нем был возобновлен домовый Трехсвятительский храм, в 2006 г. училище преобразовано в семинарию. Началось издание епархиальной газ. «Таврида Православная», главным редактором стал архиеп. Лазарь.
В 90-х гг. XX в. развернулась работа по сбору материалов для канонизации Крымских святых. В качестве местных святых УПЦ в 1997 г. были прославлены сщмч. Порфирий (Гулевич) и 7 его сподвижников, расстрелянных в 1937-1938 гг. (в 2000 причислены к общецерковным святым). В 1995 г. прославлен в качестве местночтимого святого Крымской епархии архиеп. Лука (Войно-Ясенецкий) (в 2000 причислен к общецерковным святым). На Архиерейском юбилейном Соборе РПЦ 13-16 августа 2000 г. прославлены 9 новомучеников, представленных С. и К. е. 18 апр. 2008 г. Свящ. Синод УПЦ принял решение о причислении архиеп. Гурия (Карпова) к лику местночтимых святых. В 2009 г. канонизирована к местному почитанию прп. Параскева (Родимцева), настоятельница Топловского мон-ря.
В 2003 г. кафедральным собором епархии стал Петропавловский храм в Симферополе; его восстановление началось в 80-х гг. XX в., храм был передан Церкви в следующем десятилетии. При Свято-Троицком соборе в 2003 г. был создан симферопольский во имя Святой Троицы женский монастырь, храм потерял статус кафедрального. В 2001 г. закончилось восстановление Свято-Владимирского херсонесского собора в Севастополе, тогда же Блаженнейший митр. Киевский и всея Украины Владимир (Сабодан) в сослужении митр. Лазаря совершил богослужебный чин установки креста на купол собора; на церемонии присутствовали Президент Украины Л. Д. Кучма и Президент России В. В. Путин. В 2002 г. митр. Лазарь в присутствии Президента Украины освятил соборный колокол, 3 апр. 2004 г. состоялось освящение главного престола собора. В 2003 г. началось воссоздание взорванного в 1930 г. кафедрального Александро-Невского собора в Симферополе. Во время своего 1-го визита в Крымскую епархию в июле-авг. 2009 г. Святейший Патриарх Московский и всея Руси Кирилл (Гундяев) освятил кресты для собора. В 2011 г. митр. Лазарь освятил храм во имя священноисп. Луки на территории Крымского гос. медицинского ун-та им. С. И. Георгиевского (с 2015 Медицинская академия им. С. И. Георгиевского).
В 2000-х гг. начался выпуск церковных газет «Вестник Евпаторийского благочиния» (Евпатория) и «Живоносный источник» (пос. Партенит, ныне городского окр. Алушта).
В 2010 г. в УПЦ перешел созданный в 2001 г. в составе Украинской православной церкви Киевского патриархата (УПЦ КП) муж. мон-рь во имя прп. Паисия Величковского в с. Морозовка Балаклавского р-на Севастополя. В 2011 г. «епископ» УПЦ КП Паисий (Дмоховский), насельник этого мон-ря, также вернулся в УПЦ и принял в 2011 г. великую схиму с именем Лазарь. В авг. 2011 г. обитель освятил митр. Владимир (Сабодан). Тогда же к УПЦ присоединилось и подворье Паисиевского монастыря УПЦ КП с храмом Вознесения Господня в с. Гончарном Балаклавского р-на Севастополя. В 2004-2005 гг. насельники нек-рых восстанавливавшихся мон-рей на горах Мангуп и Шулдан перешли в расколы, в наст. время ведется работа по их возвращению в каноническую Церковь.
К 1 янв. 2008 г. епархия, территория к-рой совпадала с территорией Крымского п-ова, объединяла 532 прихода (70 храмов, 462 молитвенных дома), 9 зарегистрированных мон-рей и 7 мон-рей в стадии регистрации. Решением Синода УПЦ от 11 нояб. 2008 г. от С. и К. е. была отделена Джанкойская и Раздольненская епархия, территорию которой составили Джанкойский, Красногвардейский, Красноперекопский, Нижнегорский, Первомайский, Раздольненский и Советский районы Крыма. Решением Синода УПЦ от 20 дек. 2012 г. от С. и К. е. была отделена Феодосийская и Керченская епархия в границах Феодосийского и Керченского благочиннических округов (города Феодосия и Керчь, Ленинский р-н).
В Крыму почитаются списки несохранившейся чудотворной Бахчисарайской иконы Богоматери. В марте 1999 г. Синод УПЦ признал чудотворной обновленную икону Скорбящей Богоматери из Иоанно-Предтеченского храма в с. Первомайском Кировского р-на. Привлекают паломников св. источники: сщмч. Климента рядом с инкерманским во имя священномученика Климента, папы Римского, мужским монастырем, Мариампольский источник при бахчисарайском Успенском мон-ре, источник при Космодамиановском мон-ре под Алуштой, Свято-Параскевинский источник при Топловском мон-ре, источник свт. Стефана Сурожского при Кизилташском мон-ре, источник ап. Андрея близ с. Генеральского, источник св. Иоанна Предтечи близ с. Оборонного Балаклавского р-на Севастополя и др.
архиеп. Елпидифор (Бенедиктов; 7 янв.- 25 мая 1860), еп. Алексий (Ржаницын; 29 авг. 1860 - 28 нояб. 1867), архиеп. Гурий (Карпов; 28 нояб. 1867 - 17 марта 1882, до 21 апр. 1881 в сане епископа), еп. Ермоген (Добронравин; 24 апр. 1882 - 9 марта 1885), еп. Алексий (Лавров-Платонов; 9 марта - 11 мая 1885; в епархии не был), архиеп. Мартиниан (Муратовский; 11 мая 1885 - 19 янв. 1897, до 14 мая 1896 в сане епископа), еп. Михаил (Грибановский; 19 янв. 1897 - 19 авг. 1898), Вольский еп. Никон (Софийский; июль - 14 сент. 1898, в. у.), еп. Николай (Зиоров; 14 сент. 1898 - 26 марта 1905), еп. Алексий (Молчанов; 26 марта 1905 - 5 нояб. 1910), еп. Феофан (Быстров; 19 нояб. 1910 - 25 июня 1912), архиеп. Димитрий (Абашидзе; 25 июня 1912 - 14 сент. 1921, до 6 мая 1915 в сане епископа), архиеп. сщмч. Никодим (Кротков; 23 авг. 1921 - дек. 1922), Мелитопольский еп. сщмч. Сергий (Зверев; 1923-1924, в. у.), Керченский еп. Александр (Раевский; 1924 - 19 марта 1928, в. у.), Мариупольский еп. сщмч. Антоний (Панкеев; 27 авг. 1924 - сент. 1926, в. у., 1932 - 21 нояб. 1933, вторично), еп. сщмч. Александр (Трапицын; 15 сент. 1927 - нояб. 1928), Феодосийский архиеп. Дионисий (Прозоровский; 29 нояб. 1928 - 8 июля 1930, в. у.), архиеп. Арсений (Смоленец; 8 июля 1930 - 11 авг. 1931), еп. сщмч. Порфирий (Гулевич; 11 авг. 1931 - 2 дек. 1937), еп. Иоасаф (Журманов; 13 авг. 1944 - 5(9) апр. 1946), архиеп. священноисп. Лука (Войно-Ясенецкий; 5 апр. 1946 - 11 июня 1961), Полтавский еп. Алипий (Хотовицкий; июнь - нояб. 1961, в. у.), митр. Гурий (Егоров; 14 нояб. 1961 - 12 июля 1965), Полтавский еп. Феодосий (Процюк; июль - 8 окт. 1965, в. у.), архиеп. Леонтий (Гудимов; 8 окт. 1965 - 7 окт. 1967 (в сане епископа), 31 мая 1973 - 19 февр. 1990, вторично (в сане архиепископа)), еп. Антоний (Вакарик; 7 окт. 1967 - 31 мая 1973), архиеп. Варлаам (Ильющенко; 19 февр.- 20 июля 1990), еп. Глеб (Савин; 2 авг.- 24 нояб. 1990), еп. Василий (Златолинский; 2 дек. 1990 - 27 июля 1992), митр. Лазарь (Швец; 27 июля 1992 в сане архиепископа, с 25 нояб. 2000 в сане митрополита - 11 окт. 2023), митр. Тихон (Шевкунов; с 11 окт. 2023).
инкерманский Климентовский (мужской, в г. Инкермане в составе Балаклавского р-на Севастополя, основан в VIII-XV вв., восстановлен в 1850, упразднен в 1926, возрожден в 90-х гг. XX в.), бахчисарайский Успенский (мужской, близ г. Бахчисарая, основан между XI и XV вв. на месте явления на скале Бахчисарайской иконы Божией Матери, восстановлен в 1849-1850, упразднен в 1921, возобновлен в 1991), Балаклавский во имя великомученика Георгия Победоносца (мужской, близ Севастополя, известен с 1578, упразднен в 1929, возрожден в 1993-1994), Космодамиановский (мужской, под Алуштой, основан в 1853-1856 как киновия бахчисарайского Успенского скита, упразднен в 1923, возрожден в 1992), Топловский (Тополёвский) во имя прмц. Параскевы (женский, в с. Учебном Белогорского р-на, основан в 1864, закрыт в 1923, возрожден в 1992-1993), Преображенский (Новоспасский) скит инкерманского Климентовского монастыря (мужской, на горе Шулдан близ с. Терновка Балаклавского р-на Севастополя, создан в 1996), Свято-Троицкий (женский, в Симферополе, основан в 2003), во имя вмц. Анастасии Узорешительницы скит бахчисарайского Успенского мон-ря (мужской, в урочище Качи-Кальон близ с. Предущельного Бахчисарайского р-на, создан в 2005), во имя прп. Саввы Освященного (мужской, в урочище Челтер-Мармара близ с. Терновка, основан в 2009), в честь иконы Божией Матери Корсунская (Георгиевский) скит Топловского мон-ря (женский, на Сапун-горе в Балаклавском р-не, Севастополь, создан 24 нояб. 2009 решением Синода УПЦ как жен. мон-рь, 3 апр. 2012 передан Топловскому мон-рю для устройства скита), Луки апостола (мужской, на месте бывш. с. Горянка (Лаки) Бахчисарайского р-на, основан 24 нояб. 2009), Мангупский в честь Благовещения Пресвятой Богородицы (мужской, на горе Мангуп близ с. Залесного Бахчисарайского р-на, основан 23 дек. 2010), Николая Чудотворца, святителя (мужской, в с. Холмовка Бахчисарайского р-на, основан в 2010), Феодора Стратилата, великомученика (мужской, в урочище Челтер-Коба близ с. М. Садовое Бахчисарайского р-на, основан в 2011), Лазаря Муромского, преподобного (мужской, близ пещерного городища Бакла, рядом с с. Скалистым Бахчисарайского р-на, основан 25 сент. 2013).
(на территории совр. С. и К. е.): Херсонесский Владимирский (мужской, близ Севастополя, основан в 1853, упразднен в 1924), Введенский скит - подворье бахчисарайского Успенского мон-ря (мужской, в Симферополе, основан в 1872, упразднен в кон. 20-х гг. XX в.), скит в честь Казанской иконы Божией Матери - подворье Топловского мон-ря (женский, в Феодосии, основан в 1890, закрыт в 1919), скит при Воскресенском храме на архиерейском подворье (мужской, в Ялте, основан в 1900, закрыт в 20-х гг. XX в.), Благовещенский скит - подворье алуштинского Космодамиановского мон-ря (мужской, в Симферополе, основан в 1907, закрыт в 20-х гг. XX в.).