Образована решением Свящ. Синода от 29 мая 2013 г. в пределах Республики Карелия. Включает Петрозаводскую и Костомукшскую епархии. 29 мая 2013 г. решением Свящ. Синода главой новообразованной митрополии назначен архиеп. Мануил (Павлов). 11 июля 2013 г. за Божественной литургией в Спасо-Преображенском соборе Валаамского монастыря Патриархом Кириллом (Гундяевым) архиеп. Мануил возведен в сан митрополита с титулом Петрозаводский и Карельский.